Η χειρουργική του περιοδοντίου εφαρμόζεται σε κάποιες περιπτώσεις προχωρημένης περιοδοντίτιδας και αποσκοπεί στον λεπτομερή καθαρισμό της ρίζας των δοντιών από τα μικρόβια που έχουν προκαλέσει την καταστροφή των ούλων και του οστού που τα στηρίζει. Είναι μια διαδικασία που γίνεται με τοπική αναισθησία, δεν προκαλεί πόνο και έχει πολύ ομαλή μετεγχειρητική πορεία, αφού η περιοχή επέμβασης περιορίζεται σε τομές λίγων χιλιοστών κάθε φορά. Μετά την χειρουργική του περιοδοντίου γίνεται προληπτική λήψη ήπιων παυσίπονων για να μην γίνεται αντιληπτή καμία ενόχληση από τον ασθενή. Αποτέλεσμα είναι η βελτίωση της πρόγνωσης των δοντιών και η διατήρηση τους για περισσότερα χρόνια στο στόμα.
